Conclusion
Finalement nous disposons d’une installation (base) assez propre qui minimise le nombre de paquetages (de l’ordre de 220-230 suivant la plateforme) et qui permet de faire beaucoup de choses.
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_openmp_mutex, archspec, attrs, beautifulsoup4, biopython, boltons, brotli, brotli-bin, brotli-python, bzip2, ca-certificates, cairo, certifi, cffi, cftime, chardet, charset-normalizer, colorama, colour, conda, conda-libmamba-solver, conda-package-handling, conda-package-streaming, contourpy, cpp-expected, cycler, dateutils, distro, double-conversion, eigen, et_xmlfile, exceptiongroup, expat, fmt, font-ttf-dejavu-sans-mono, font-ttf-inconsolata, font-ttf-source-code-pro, font-ttf-ubuntu, fontconfig, fonts-conda-ecosystem, fonts-conda-forge, fonttools, freetype, freetype-py, fribidi, frozendict, getopt-win32, giflib, glib, glib-tools, graphite2, graphviz, greenlet, gst-plugins-base, gstreamer, gts, h2, harfbuzz, hpack, hyperframe, icu, idna, importlib_resources, iniconfig, intel-openmp, jdcal, jsonpatch, jsonpointer, jsonschema, jsonschema-specifications, kiwisolver, krb5, lcms2, lerc, libarchive, libblas, libboost, libboost-python, libbrotlicommon, libbrotlidec, libbrotlienc, libcblas, libclang, libclang13, libcurl, libdeflate, libexpat, libffi, libgcc, libgd, libglib, libgomp, libhwloc, libiconv, libintl, libintl-devel, libjpeg-turbo, liblapack, liblapacke, liblzma, liblzma-devel, libmamba, libmambapy, libogg, libpng, libsolv, libsqlite, libssh2, libtiff, libvorbis, libwebp-base, libwinpthread, libxcb, libxml2, libxslt, libzip, libzlib, lml, lxml, lz4-c, lzo, mamba, markdown-it-py, matplotlib, matplotlib-base, mdurl, menuinst, miniforge_console_shortcu, mkl, mkl-devel, mkl-include, mkl-service, mkl_fft, mkl_random, mock, munkres, networkx, nlohmann_json, nose, numpy, openjpeg, openpyxl, openssl, packaging, pandas, pango, patsy, pcre, pcre2, pillow, pip, pixman, pkgutil-resolve-name, platformdirs, pluggy, ply, poppler, poppler-data, pthread-stubs, pybind11-abi, pycairo, pycodestyle, pycosat, pycparser, pygments, pyparsing, pyqt, pyqt5-sip, pyrsistent, pyside6, pysocks, pytest, pytest-mock, python, python-dateutil, python-tzdata, python_abi, pytz, pytzdata, qhull, qt-main, qt6-main, referencing, reportlab, reproc, reproc-cpp, requests, rich, rlpycairo, rpds-py, ruamel.yaml, ruamel.yaml.clib, scipy, seaborn, seaborn-base, setuptools, simdjson, sip, six, soupsieve, spdlog, sqlalchemy, statsmodels, swig, tbb, texttable, tk, toml, tomli, tornado, tqdm, traits, truststore, typing-extensions, typing_extensions, tzdata, ucrt, unicodedata2, urllib3, vc, vc14_runtime, vs2015_runtime, wheel, win_inet_pton, xorg-libice, xorg-libsm, xorg-libx11, xorg-libxau, xorg-libxdmcp, xorg-libxext, xorg-libxpm, xorg-libxt, xz, xz-tools, yaml-cpp, zipp, zlib, zstandard, zstd |
Cette installation devra être complétée par quelques paquetages en version (prod) ou nous passerons d’une installation généraliste à un environnement métier avec des outils pour la biologie, la chimie, les statistiques … Lorsque l’on utilise miniforge3, les paquetages bio (biopython, biopandas) peuvent être tout à fait installables en environnement (prod). Je les laisse ici parce que dans une installation miniconda3, les versions defaults (Anaconda) et conda-forge n’étaient pas les mêmes et que l’on pouvait avoir intérêt à garder la version antérieure (1.73 au lien de 1.84).