Catalogues de ressources

Je regroupe ici quelques listes de pointeurs, utiles pour trouver du logiciel, des bases de données … ou pour l’histoire. En effet, lorsque une discipline émerge, des listes de ressources apparaissent sur le web, ce qui a été le cas bioinformatique, pour les outils de modélisation et de visualisation, les banques de données de molécules. Mais au fur et à mesure que la discipline s’installe, ces listes de ressources (directory of … en anglais) ne sont plus maintenues et incluent de plus en plus d’erreurs, car ce travail n’est plus suivi, n’est plus valorisant ou n’est plus financé. Donc les catalogues n’ont qu’une valeur limitée … dans le temps.

Version 1.4 – Mise à jour mars 2025

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• Catalogues : Click2Drug

  Dans le domaine du drug-design au sens large, il nous reste Click2Drug opéré par l’Institut Suisse de Bioinformatique (Swiss Institute of Bioinformatics). Le catalogue est très exhaustif et recouvre la ...

• Catalogues : logiciels tiers

  Un catalogue pour les outils à finalité recherche que l’on peut installer sur son ordinateur personnel, hors langages informatiques, outils de modélisation et toolkits. Peu de références pour éviter une ...

• Catalogues : bases de données

  En évitant de générer une nième page de ressources qui sera rapidement obsolète, cette liste regroupe des sources de données pérennes dans la durée et qui sont extensivement référencées dans ...

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Nous avons tous participé à ce type d’initiatives, et depuis très longtemps, y compris avant le web tel qu’on le connait aujourd’hui. Par exemple, nous avions des listes lisibles par Gopher et interrogeables par Veronica. C’était au tout début des années 1990, avant l’arrivée du World Wide Web, du HTML, des premiers navigateurs (Mosaic, Netscape …) et des moteurs de recherche, du coup ce type de ressources était très important pour la communauté.